Marker information




Marker Name AHS3040
Additional Name FS977031;AHS3040_c2;AHS3040_c1;AHCR12G07
Marker type EST-SSR
Forward primer (5'-3')
AGGCATTGCTAACACGGTTT
Reverse primer (5'-3')AAATCCTAGCTAGAAATAGGGGAAA
Resource Koilkonda et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sequence ACTCTTCTATCAAATTTATTTTCAGTGTTTAATTAGGTCCAAAGAATCATGGAGAGGACACGATTTGGGCTTTTCTTCTTCCTTCTCTTTCTCCTTGCTTCTCAGATGGTGGTCCAAAGCGAGGGAAGACACTGCGAGTCAAAGAGCCACCGGTTCAAAGGAATGTGCGTTCACGAACGCAACTGTGCTTCGGTTTGTAACTTAGAAGGTTTCTCCGGCGGAAAGTGCCGCGGCTTCCGTCGACGCTGCTTCTGCACCAGGCATTGCTAACACGGTTTAAACCTAAGATCTAAGGTTTCTTGTTATTTGAGTCAGCTCGTAGTAACGTTAAATAATAAAGAATGTATTAATTAATTGGTACATGCAATGTATGCATGCATGGTGCTAATTAATTAATTAATTAATTATAAGTACCAACCATGTATGTTTTATTTCTGTGGTTTCATTATATTTATTTCCCCTATTTCTAGCTAGGATTTAATTTGTAACGAATAATCTTGTTCTTCAG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHS3040AHS3040_c1A03 69.111 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHS3040AHS3040_c2A08
104.043
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHS3040AHS3040TA08
88.849
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013