Marker information




Marker Name AHS3174
Additional Name FS979568;AHS3174_c2;AHS3174_c1;AHCR20C13
Marker type EST-SSR
Forward primer (5'-3')
AAATTGTTTGATAATTTCGGCAA
Reverse primer (5'-3')CAATGGAGCTCCTCTTCCTG
Resource Koilkonda et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sequence ACCCATCAATGGCCTCTTCCATAAAATATACCAGCATAAATATGAATAAATTGTTTGATAATTTCGGCAATAATAATATTAATCATAATAACAACAACAAAAATGGTAATGATAATGATAATAAAATAAATATTTAAAACTGGCAAGGAACTATTATGGTTTTTAAATAAAACTACAGTCCGCAACTATTACAAGCTCTCACTTAAAAGCAGCAGGAAGAGGAGCTCCATTGGCTTTCTTTGAGGAATTGGTGTCAAATGGGCTGTTGAGCTCGTCCCATGCTTCGATCCAAGTGACCATGGCATCAGCAAGCTTGACAAAGTAGGGATCAATAGGGCCAAGCTTCTCCTTGACTTGCTTGGAGAGCTCAATGTAGCACTTCTGGACGGAGGTGCATTCTTTAGGAAGAGTGGCGGATTGGAAAAAGGGAATGATGTCTTCTTGCCAGAAAATGCCTTTATACTCCTTTTTGAGGTTCACAAATGGATTGCTTGCTTTGCTGTGCCAAATGTATGGGAGACCAGTCTTCACACCTAATCCCAAATGGTCACAGATAACCTTCATGCACCAGCCAGCCCACATATCATCGTATCGTCCAATAG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHS3174AHS3174_c1A05 51.457 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHS3174AHS3174_c2B05
45.146
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHS3174AHS3174TA05
21.923
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013