Marker information




Marker Name AHGS1676
Additional Name KICT11E24;DH964892;AHGS1676_c1;AHGS1676_c2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
CACAGTTTGTCCCTTCCGAT
Reverse primer (5'-3')GAACCGGCTGAATCTGTCAT
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CTTCATGCAACGAAAAAGATGAGGAATGATGAGAAGAGGGCTAAGCAAACCTTCCACAAGCAACAATGGTACCCACAGTTTGTCCCTTCCGATGGTGATGGCACTCTCTACCGGAGAAGATTCCTCTTCGGCGATACTTTAAGAGAAAATGAGGGATGGTGGCTGGGTTCCAAGCAGGTTTAGGGTTGGCTTTGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTTATTCTTATTTTAACTTTTTTTAAACAAAACGACGTCGTTTGAGGGGTATCCACCAAACTGGATAATGCTTAAAAAAATTGGCCGGTTCTGACAATTCATCGGTCAATGACAGATTCAGCCGGTTCTCAAGCCAATTTTTTGCCAAACGGCTCTTAGCATCAATCGAACTGTTCAGATGACCAATTTTTTATTAATCCAATTGAATTGGTTGGTCTGGTTTGATTTTTAAACCATGCATATAATAGTAATACGAATATAGAGTAAAATCCCACCTCAGCCTCCTAATTATTGCTTAAAATAACAATCTACCTTTTATTGATCGAAGAATGACAATGCGGCCCTAACTACTAATTTCATCATACTTTCAAGCCCTTTTGTTAAACTCTTCATCCAAAGTTAATGGATCTTGCCTATTGTAATGTTAACTGATTTTGTGTTAAGGAACCGTTCCAAGGGACAAAACATTTCCCGTCGTGTTAGTAATACGCTGCAGTAAAGTAAGACAAGTAAACCTCTGCAAAAAAATTTTATGAGACACGTAAACTCCTAACTAATTATAAACATAGACATATAAATCCATATGAACCATAAAGTATGACAAGTAACTATAATTTTTAACAATATATTGTATCTGCTACACTGGTTGCTAG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Satonoka x KintokiA. hypogaeaAHGS1676AHGS1676LG05.1 78.526 Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1676AHGS1676_c1A05
51.244
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1676AHGS1676_c2B05
47.176
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS1676AHGS1676TA05
23.617
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013