Marker information




Marker Name AHGS1778
Additional Name SAAC06H20;DH964992;AHGS1778_c1;AHGS1778_c2;AHGS1778_c3;AHGS1778_c4
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
CGGCTGCGGTATTCTGATAG
Reverse primer (5'-3')GGATTTTGGTTATGAAATGCTTG
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CAAAATCTTATTCAAATTAAACAAACAAAATTAAAAACAAAATGAAATTAAAGACAAAATAAAAGGTTATCGACGGTTGCGTTTCCTCCCAACAAGCGCTTCTTTAATGTCACTAGTTTGACGGTTGCTTCTTACTAAGTTGGAGGTGGATCATAGTGTAACACCCTAACTATCAAAGTGTCACACTTCCGGCTGCGGTATTCTGATAGTTCGGGAATTATGACGACTCTTAAATTATTTAATACTAAAATAGGAGCCTGTTTAAAAGTTAAGCCATATTTTTCAAAAAACCAGATTATTGAACACACACATCCATACTTAAAATACAACTTACAATACTTACAAAGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATAGCATTAATTTACAAGCATTTCATAACCAAAATCCTATCCCTCTTATAAAAACTTGTAATGATAAATGCGAGGAAAAAGTAACTAATACAAAACAAAATATTGTTTAAACAGAAACGAAATAAATAAACTCTTCTGAACTTTGTTGTCCATAACCTGAGAAGAAAAGACCTGTAAGGGAGTGAGAACATCGTCCTCGTTAGTTCTCACTATAGGATTAGAGAATTACTATAATAGAATACGTGAAAATAAAACTGTTATTAAAGTATAGTGATTAATAGCCACCTTATGTATTTTTTCAAAACCGGAGATTTATAACCAAGAATCCGAAATCCTTTCTAAATGATAAAACTATTAACTCTTCAAAAATCCAAAACCTTTTTAAAATTTTTTTCTAGACAGCATGAATGACCAAGCTGTTCCAAGCATAGGTTCATTAAGTCTATGTTG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1778AHGS1778_c1A04 50.278 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1778AHGS1778_c2B04
67.118
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1778AHGS1778_c3B07
89.802
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1778AHGS1778_c4B10
61.614
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013