Marker information




Marker Name AHGS1796
Additional Name SACT05N04;DH965010;AHGS1796_c1;AHGS1796_c2;AHGS1796_t1;AHGS1796_t2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
TCCATTCCATGTGCACCTTA
Reverse primer (5'-3')GGAAACTCCCCAATCACAGA
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence AAAGATGTGTTAAAATATGAAAAATTAAAGACCAACCATATAACCCGAAACAGAAAAAAATAAAAAAGAAAACACACTCATTTTCTTTAGTAGTCCGATATTCCATTCACTATTGAACTGAAAACTTCAGAAATAATTAACATAAAATAGTTACAATTCTAACAACTCTTACTCCCTAGTTCTTAAAAGGACAAATTTCAACAACAATTGACCATCTTCTAGTTCTAGTATTCACTAACTAAAATCCTTAGGGGATCCAAATCAGGATTGGTTTCCAAGTTTTCCACATATAGTAATAATAAGTTAACAACTTAAAAACAAGAGTTGATACATTTATTGTTATATTAAGAGTTTACTAATAGTTATATAAAAACACCCTTATTTAATCATATTTATACACTATTATTTAATTTAATTGTTTTACAATTATAAATTATAATAGATGTTTGAGTTAAATATTTATACTGCTATAATAATTCATAATTAAAATCTGTCTAAATTGTTTTACACAAGAAAGTACATATAAATTAAATATTTATATCAATATTATTTAGAATGAGGTATGAAAATTTGTTAAAAAATTAAAAATTATGTTACATTTATTTAGGATGTCCTTAGTTTTTCACTCGCTTTCTCTGCATATGTGTCTGTCCAATTCATGCTTTGTTTCCATTCCATGTGCACCTTATTTCCTTACACTGCAGCTTCCCATCTAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTTCTTGCTCCATTGTGTTGTTCCCAGCTCAAAGATTTCTGGGATAGTTCTGCCTTCTGTGATTGGGGAGTTTCCTTGGG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1796AHGS1796_c1A08 26.176 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1796AHGS1796_c2B07
89.749
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS1796AHGS1796_t1TA08
18.253
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS1796AHGS1796_t2TB07
33.484
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013