Marker information




Marker Name AHGS1821
Additional Name SACT13N13;DH965035;AHGS1821_c1;AHGS1821_c2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
TCAAGCATCCCTTCTCTGCT
Reverse primer (5'-3')AAAGAACCAAAACAAGAAAGAGAAAC
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CACGCAGCTAGCGCACTCTTTTTATTTTGCTTATTCTTTATGGAAATTTGTTTGTAGTTTGGTTTTGGAAAAGAGGCTCACAAACAACCCTTTAATAATGTATTGTATAATTGTATGAGAATTCCTTAAAGAGATAAATCTTTGAAACATCACCTTCATTTGGCAGAGTATTGTAGTGTTTCCAAGTAGCCCCAATTTGAGATTTCAATAATGTAAATGAAGGTTGTTTCGCAACTAGCTAGTTGTAGCCTTTTATTTTCTACAGTAGAAACTACATATACATGGTACTCTAAATAATGTTGTGTTATAAGGAAGCAATCAGTGTCTGTCTTTTGGTTGATTGATTGTATGAATAATTGAATATGTTTTTTTTGTTATGGCTCCAAATTTTCTTTCACTTCGTTGTAAATTTTCTCCAGTTTGAGCTACTTATAATTGGTCACTAGTTTTGCCTGTTAAAACACAAGGAAAAGGGACAAGCAAAGCAAGTAGTTAGAATCTTAATTTAGGACTTCAAATTACGATTTTCAATAAATCAATTTTTTTTGTTCTTTTTACAATTAGTACTATATTATAGTTAGTACTAAGTATTATTGATATCTCAACATTTAGAGGATTAACCCTTTCTGAGACAGGAAGTTAGGGAACGTTGGGAATGTAAGATGCTAATAATCTCAGATTTTTTAGAGATATATTTGTTCAAGCATCCCTTCTCTGCTTTTAACACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCAATATATACATTATGTGGTTTCTCTTTCTTGTTTTGGTTCTTTTTTAATTTTATTTTCTAGGGCACCTTG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1821AHGS1821_c1A09 74.614 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1821AHGS1821_c2B01
42.196
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013