Marker information




Marker Name AHGS1879
Additional Name SAAC14P17;DH965093;AHGS1879_c1;AHGS1879_c2;AHGS1879_t1;AHGS1879_t2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
CCCAACAACATATGCAGCAA
Reverse primer (5'-3')CACACACGCACAAGTTCACA
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence TATTCCCAAATAGCTTCTTTATCTTTAATCCCCTCCAGTTTATGAAAATTAATGGACAAACATCTGAATTCCTTGCCACTGTGCCCAATTTGCTCAAGTTGTTTACAGCTTCATGAGTAGGACCAATTGCCTCTCCTTCAATATCTAGAGTAATTTCTTCTCTATCTTCCAACTGTCTTGCATGAATCTTCAAGCATTGTGTAGGTCCTCGTGTTTTTCAAAGAGACTAAAACATTAATATTTTTAGCATTATATACCATCCCTCTTATTGATTTATATATGTTTAATTAAAAAAAAACAGCTTCATCCATTTAGCTAAATGAATAAAATTCCATAATTTCACTATTGCTAATGATTTATTCCAGCTACCTAGGAAACTAGAATTTGCTTCTAAAACTAAAGTCAAAGTGTAAAAAGAGTCAAATAGATCCTTTTCTTATATCAAATCATAGTATATACATGTACCTTTTCTTGTACAATTAATGAGTACTTCTTGTACAATTAATAAGTACAGATTCTATTCAGATATTGTTCCTATTCAAATCCTATTCAGATATTGATCTCATTTCAGTGACAAATTTATCACTTGATAAAATATAAATTGTAATATAAAAATAGCCCAACAACATATGCAGCAATATATGTTGAAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACTGAAGTGTGAACTTGTGCGTGTGTGGGGAACTAGCCCACCATATGCAGCTACACAAACATAATAATTTTACGTTAACTGAAGTGTGAAATTGAAATAAAGAAAACTTAAAAATATTATAATAAGTTATGAGCAATATCTATTTTGCTTAAATTGATACCGGGCTTCTGC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1879AHGS1879_c1A06 59.831 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS1879AHGS1879_c2B08
63.469
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS1879AHGS1879_t1TA06
58.312
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS1879AHGS1879_t2TB08
27.894
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013