Marker information




Marker Name AHGS2013
Additional Name SACT11H18;DH965226;AHGS2013_c1;AHGS2013_c2;AHGS2013_t1;AHGS2013_t2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
CCATCCTCAAGCTTCTTCCT
Reverse primer (5'-3')GACGACAGAACACCAAAGCA
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CTAGTCTGTGTCTGACCAAAGGGTTAATGAACGAGGACTTTCAAAAATACCTCACAAGTAAACTTAGAGTTAGATCCAAACCATATCTTATCCTATTCGTTACCATCCCTCTTTGTAGTTACTACCATCGCGCAAATTTACTTTCTTGCTACGAGTTAATAGTCAAATTAGTCTTTGAAAGATAAGATATTATTTAAATTCATTCCTGAAATATTTTTTCAATCAAATTGGTCCTTCAAAGATTACAAATTAATCATATCTTTAGTTACTCCAATCACAATTTTTATTAACAATTGATGATATAAAATATTAACTGAATATGTTTAATTAGACGTTGACTAAATATGTTTACGAAAATCTATCAATTTAATCACTAGGTCATATTACGAATAGAATTTTTGTATTTGAGAAAAATGACTAAATTAATAAATTTTCATAAACATATTTAATTAATATTCAATTAGACATATCAAGTATTATATATGTTATTAATTGTTTTATAACATCAATTTTTTAAAAAAACTTGTTAATAAAGTGATTGAAAGATAAATATAATTAATTTATAATAAATAATTTAATTAAAAAAATTTTAAAAATAAATTTAAAAAATATCTTATATTTCAAAGACTAATTTAACTATTAACCCTTGTTAGTAACCTGAATCTAAATGCTTCACTCGCTAGTCGATACTGCTACCATCCTCAAGCTTCTTCCTGTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTACAGTTGTATGTCACCTGCTTTGGTGTTCTGTCGTCGTCCTGCTTATGCATGTTCTTTTGCTCGTCGACAAGGAAGAACGCCGCACTCGTCCCTGTGCTTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2013AHGS2013_c1A03 67.042 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2013AHGS2013_c2B03
46.912
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2013AHGS2013_t1TA03
27.985
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2013AHGS2013_t2TB03
56.406
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013