Marker information




Marker Name AHGS2179
Additional Name SAAC13B01;DH965392;AHGS2179_c1;AHGS2179_c2;AHGS2179_t1;AHGS2179_t2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
ATCTGGAGTTCCCTCTGCAA
Reverse primer (5'-3')GAAAAAGAGATAAGCAAGGCG
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence TTCTGTATTCTACTTGTGTTTGCTTTGTTTGCTTTGTTTGTCTGTGTGGATCTTCTGGTATTTTGGAGGATGGTAAAGGAAGGGGAATAGTTGAGGGTTTTAGTTAGAGTTGAGTTAGAATGGAGAACCTTAGTGGACCACCCTGATTATGGCTTTCATATTTAAATCCATTAAGTTTTATAATCAAGAGCATCAAAGTTCTAGGATTGCCTCTGGCTTTTCCGGGACCTTATTTATTATATATGTGGGCACCTTAACCATACTGAGAATCCCCGGTTCTCATCCCATACAATATTGTTGTTTTTTAGATGCAGGTCGAGATGCACCTTAGTGAGCATCTGGAGTTCCCTCTGCAAGCGAAGTTGGTTATTCTGGGATTACTGTATTATGTTTTATGCTTTGTATATAGATTTTCCACCCTTGTATTTTGTATTTTGTCCTTCCTAGAGGTCGACTTGGAGAAACAGGTGTTTTGTCATATATTTGGGGTTACTCTTTTGGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTATCTTTGGAATTCTTCTCTTAAATTTATCTCTTATGCGAGTGATACGATTTTCTATTTAACGCCTTGCTTATCTCTTTTTCACAGGCTTCTAGTTAAAATTTCTTTCAACTATCTCTTATATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATATATATATTTACTATTAGAGGTCGTAATATGTTACCACCTCAACTTTATGACTTAAGCATAAGACTCTGTGTGGTAGGGTGTTACATATGTCACCCCCCCGGAAGGTGAATTTTGGACTTTTGCTCAATTTTCTTGAATACAAGCCCAGCTTAAAGATAATTACAACTCTCACGGAAGATTAATTAAGGGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Satonoka x KintokiA. hypogaeaAHGS2179AHGS2179LG09.1 60.04 Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2179AHGS2179_c1A01
81.745
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2179AHGS2179_c2B09
69.4
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2179AHGS2179_t1TA01
40.484
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2179AHGS2179_t2TB09
20.704
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013