Marker information




Marker Name AHGS2509
Additional Name KIAC07K06;DH965721;AHGS2509_c1;AHGS2509_c2;AHGS2509_c3;AHGS2509_t1;AHGS2509_t2;AHGS2509_t3
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
GTTAATCCCGCCTACGTTCA
Reverse primer (5'-3')CACATTCCCTTAAGATGTCGC
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CATACGCGGAAGGCATGCGTACGCATGACCACTCTGTTTTGAAAAAAATTGGATTTTTGAGTTTTTGACTATTCCTTTAGTTTTCTAAACCTCCGTAGCTATTATTTAAGGTTTAGGGTTTGGGATGAGCAAGAGTGTATTGGGTGAATTAAAAAGGGTATTTTTTGTTATAAGTTTAGAGACGGTGACTTAGATTTGTAACGTACTGTGAATGGAATAACTAGAGTGGGTTGGTGGAGTGGTATGTCGATGATAATTTGAGAAAAGAAAAACTAATGAGGTATTATTGTTGGTGAATTGTTATGTACCTGGCAAGGACGGTGGTTAATCCCGCTTGTAAAGGTTGTAGCTCATCAGATTATTGATAAATCATTATGTACCTAGCAAGGATGGTGGTTAATCCTGCTTATCGAGGTTGAGACTCATGAGATTATTGGTATGTCGCTATGCGCCTAGCAAGGACAGTTAGTTAATCTCGCTTGTCGAGGTTGCAGCACTAGCGTAGGGATGGTTGGTTAATCCCGCCTACGTTCAGATGTGGGGTCTATATCCGATAAAAGTGTGCTCGAACACTATATCCCGTAAGAGTGTGGTAGGGCACTATATCCCAGGGTGTACACACACACACACACACACACACAGATATATATATATATATATATACGTGACAGAAAGGCGACATCTTAAGGGAATGTGTTGTGTTAACAATTGAATCGACAAGTAATATCACATCCAATAGAAAGACATTCATCATGTG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2509AHGS2509_c1A05 50.483 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2509AHGS2509_c2B05
50.834
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2509AHGS2509_c3B10
60.484
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2509AHGS2509_t1TA05
24.075
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2509AHGS2509_t2TB05
28.726
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2509AHGS2509_t3TB10
20.215
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013