Marker information




Marker Name AHGS2638
Additional Name KICT08E01;DH965848;AHGS2638_c1;AHGS2638_c2;AHGS2638_t1;AHGS2638_t2
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
TGTATTGCATTCCCTCCCTC
Reverse primer (5'-3')TTATGCCATGGGAAAAATGG
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CAAGTGCTGGTTACCTGCCGTAATATAGAAAGTCATTCTCCTCCAACGCAATACTCCAAGATCAACCATAAGTGAGCAGAAGTTTCATACCTATAATGACTAAAAGCATAAGTTAACAACCCTTAATATAATTTTAAGGAATTAGAGCATGTAAGAGTGAAAAACTACAAAGGAACAAAAGGCATAGCCATCCAAATCATCAATTTAATTTAAGCAGATAAAATATTTGTATTGCATTCCCTCCCTCCCACGGTCTCTTTCTCTCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTTTTCTTACAATTATTAATCATTAATGATCATTGTTTCCAAATTTGAACTATGTGAGTTGCATTAAGTGCAACTATCATTAATCTTATGTGCATAATCAATAATAACCACTTCATTCTTTTAATACAAAGTATAACACTTGTTAGCTAAGCATGTTATCCTCGTTTTGAATCTCCATTTTTCCCATGGCATAATTAACAGGTAAACAGGGTTTCCTCATATTTGTATTATCCCAACCCAATTACGCAAAATTAATAAGTAAAAAAATAGACCTCACCACTCATAAAACTTGAGCACGTTTTGATGATCTAAAGAGTGAAGAATCTTTACCTGCAGAAAGAGAAAGCAAAAAATAAAATCACACAAAAACGAACAAAAATAAATACTAATTATCTTAAAGATTCCAATCCAGTTCGCACGACACAGCTCAGATAGAATCTGTTAAAATGGAGTAACTAAAGTTACTATTCTTAATCATATTGAGCTCATTCGATCTATTTTTTGATATAAACGAAAAGACTTACTTCGTGAAGAACCTTGCTTCTCTGCGACTTGTCTACGCTTTTGATGGCG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2638AHGS2638_c1A04 23.976 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2638AHGS2638_c2B04
39.905
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2638AHGS2638_t1TA04
27.711
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2638AHGS2638_t2TB04
51.898
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013