Marker information




Marker Name AHGS2960
Additional Name SAAC07O22;DH966168
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
CTAAAAGCCCCACACACACA
Reverse primer (5'-3')CCCATTCGAACCAAATCAAT
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence ACAATAAACATGTAATATTAATATAAATAATCTAAACATGTTAAACACTAAATACATTAAAAATTAAACTCATTAAAATCCAAACATATTAATAGTGAATAATCTCACTAAAAGCCACTAAAAGCCCCACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATAATCGGGTTCACAAGTTGGTTCAGATTCTGCACCCCCAGAACCGATACTCGAACCAATCACTAACAAAGGTCATTGATTTGGTTCGAATGGGACCCGATTACCCGTTGATTCTAGAACCAATTTAATTAGTTCGATTCGAATTCGGACAGGTAATCGAAAACCGCTACCCGTACTCACCCCTATTAAAAGTGTATCAATACATAACACTTATTTATTGTAATCTAGTCTATTAGTAATAATGGAAACCATCTTTCAATTTGGACAAAGAGTTATCCCTATTATATCCCTTCATATTTAAGGTTACTTTCAAGATTAATCCTGAGGGGGTGCGTGATAGAGGGTGGAATACTGTAACTACATACAATTGTTTTTGTTAAATATAATTTGTCTCTAACAAAAAACAAATGCAACTTAAAAAAATAATACTTCGATCAATGTAAAAATTTGACCTCTTGATAAATATGAGAAGATTATGTCATTTGAGTTGTAATTCGTTAGCATCAATGACCGAATGTTAAAAAAGAGTAAGCTCATCAACTCATCTTTAATTTATTAATAGCTGGTCCACTATTCATGCCATGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Satonoka x KintokiA. hypogaeaAHGS2960AHGS2960LG04.1 88.985 Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS2960AHGS2960B04
35.527
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS2960AHGS2960TB04
57.875
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013