Marker information




Marker Name AHGS3040
Additional Name KIAC09P10;DH966248
Marker type Genome-SSR
Forward primer (5'-3')
AACTCTAGGCGGTGATCTGG
Reverse primer (5'-3')TCAACCTCTAGGAGGGACGA
Resource Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sequence CCATAGGACAGACATGCATCATGTGCATTTGTATAATTTGTTCGGGTATGAATATCGTGTTTTGGCTTGCCTATTTAATTATCTGTATTTATATGCTACGTGACTTAAATGTTGTATCTGTTTTCTTAATTGTGTATTACTCCTATGCCTGCTTGTATGTGTTTGCTTTGAAAGACCCCTCATGCTGATGGAGACGACGTTGAGGGTTGTTCCAAACTGGCGATTGGGAGGTTTGTAGAGAACTGGAATTGAAGAGATAGATTAGAATCTCTAGGTAGAATTACCATATTTCTGGTTAGTGAGAACTCTAGGCGGTGATCTGGGTTGTAGAAGCTTAGGATTGTCTTTGACTTTTTTGAGCCTTATATTTATCTATTGAGCACTGTTATCATACTGAGAACCTCTGGTTCTTACTTCATATGTATTTTGTTATTTTTCAGATATAGGACGTGAGGTACCTTGATGAGTGTGCTGGAGACTCCTTCAGAAGCGAAGATGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAACTTGTATCGTCCCTCCTAGAGGTTGATTCGGAGAATCAGGATTGGTATTTTATCTTTTGGATTGTTTTGGGTTTTATATGTATATTTTTTTAGCCGGTGATAAACCTCATTTTTAGGATTTATCTTGTGCTTAATTTAGTGGATTTTATCCATTATTTTCACACTTATTCATAGAAATCGCATGTTTTACATTTTTCTTCCTAATTTTGTACTACGAGTGAAAACATGCTTCTTTGG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaAHGS3040AHGS3040A07 76.095 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisAHGS3040AHGS3040TA07
38.250
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013