Marker information




Marker Name Seq13A04
Additional Name BZ999588;pPGSseq13A4
Marker type SSR
Motif / Pattern ga
Forward primer (5'-3')
TCCACAGCAAACCCAAAAAT
Reverse primer (5'-3')AAAATCCCCTGAGAGCCATT
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TAAGTATTTTGCTGTTGATTTTTAAAGTCGCAAGTAATTTGCTCTGCAAAAAATTACTAAAAGTTGTATGCAGTTTTGAGAAAGATTAATAAATTCTATTGAATTTTATTATTAATTTAGTTATGAATTTTTTGCACGACTAATAGCTATGTGTATATTAAAATTAGTTATTAAAATTAGTAACTAATTAAAATATATATTAAAATATAAATATATATTTAAAAAATTAAATTATACGTATATTTATACATAACGATAATGTTACAAAAACAAAAAAACAACTAAAATTTACTCTATTTATTATTTTTTAATTATCACAATAATTAATAAATATTAAATATTTTCGTATACACAAATACATTAGTTTGGCGCATGTCAAATTTAAAATTCAACTATAACTTTCTAAATCTTACCCACTTTCAATCATATACCACAAAAAAATATCGCATTATAGTCCACAGCAAACCCAAAAATTATTAGACTAAAATAAGTACTCAAGTCCTATGTGCTTTCGTTGATGCTGATCGNTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGNTCAAAATTAATGGCTCTCAGGGGATTTTGCCGTGGACCGANGTTCGACTTTTGATGCCCA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaSeq13A04Seq13A04A03 58.554 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisSeq13A04Seq13A04TA03
20.055
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013