Marker information




Marker Name Seq16C03
Additional Name BZ999847;Seq16C03_c1;Seq16C03_c2;pPGSseq16C3
Marker type SSR
Motif / Pattern taa
Forward primer (5'-3')
TGATTCGTTCAACCACCAGA
Reverse primer (5'-3')CCCTCAAACAGCAAACAATG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TACATGTAAACGGTCTCTCTGTAGACATGATACATGATAGAGCACAATGACGTCGTTTGATTCATATAGCCGACCCCATTTAGTGGGACAAGACTTTGTTGTTGTTGTTGTATTATTTTTTTAATATTTTTTATTTATATTATATGAATATATCAAAAATAAAATCTTATTTAAAAATTTAAAATAATTTTTCATTGATATAAAATTATTAATAAATGTATGCATTTACGTTTGTGTGTCATCTTCAATTATATAAAACTCGCCACTCTGATTCGTTCAACCACCAGAACAATAATCAACCAGCAAGAAAGAACCATCTTCTCATTATTATTATTATTATTTGTTCATCTATTTGGGTATCAACGTTTTCGTAGCTGTGAAAGGCGCAAACATTGTTTGCTGTTTGAGGGTATGTTTTTTAAATTTAACAGTATATACCCATTTTGGTTTTCAAAAAATTTCAGATTGGACACTTTAGTTCTCAATTAAAATTAATTATTCGATTGGTTCTTAATAATTAATTTTGTCAGTCACTTAGGTCCTTTATTCCGTTACTAATGGAGGGACAAAA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaSeq16C03Seq16C03_c1A02 29.808 Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaSeq16C03Seq16C03_c2B02
86.333
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisSeq16C03Seq16C03TA02
39.601
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013