Marker information




Marker Name seq18E07
Additional Name CC000034;pPGSseq18E7;pPGSSeq18E7;Seq18E07
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (TAA)20
Forward primer (5'-3')
AACGTGCGTGGAAAGAGTTC
Reverse primer (5'-3')TGAGAGTGGTTTTTGTTGGTG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CTCTTCATCACAATTGATTTTCACCGAGTATATATAGAATTTTTACTCTTCATAAACCGTAGAAGGGTACCACAGTTTATGTTTGCATGACTCCTATTTATAAACCGTGAAAGGGGTATCACAGTTTATGTGTATAGTGCTTTCTTCATAAACCGTGGTAGGTTTATGTGTTAATCCTAAAACGTGCGTGGAAAGAGTTCCACGAATTATATAAAGTAGTAATAAGACACGCAAGTAAACACTTCTCAATTATTGTATTTAGGTAAAGTTTTCCTCCATTTATTTCATTTACGTAAATTGCCCTTAATATTATATGTACGCATTATGTATGTATGTATTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACAGATATGCTACACATCCAAGTTTTATTGTTATTCAAGTTCAACCAAGTAGACCTAACACCAACAAAAACCACTCTCATTAAAAAGACGTGTACATGCGCTCAAAATCTCCAACGTAACTCTTCGCGCTCTAATATGAA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18E07seq18E07B02 110.2 Gautami et al., 2012b
Satonoka x KintokiA. hypogaeaseq18E07pPGSSeq18E7LG02.1
61.46
Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18E07Seq18E07B02
74.009
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18E07Seq18E07TB02
32.592
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013