Marker information




Marker Name seq18G1
Additional Name CC000049;pPGSseq18G1;seq18G01;Seq18G1;Seq18G01_c1;Seq18G01_c2;Seq18G01_c3
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)6
Forward primer (5'-3')
AATAGGTTGTGAAGCACGCA
Reverse primer (5'-3')TTCGGTGGTACTTTTAAGGCA
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Qin et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TGAATTATAAAAAATATATATAATATATATTAATAAAAATTAACGGTTAAAACAACTGAAATACTGGTGTTTTTGATACCTTTAAAATTCTTTCTATATTATTATCCACCGTTATGAATAAATAGGTTGTGAAGCACGCACAAAGGTGCAGGCATGGAATTGCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAACAAAAATGAAATATATTAATAAATAATGTTATCCCTTATCTTTCACATATCCAGTATCCATTCACTTCTACGAAAAGAAATGAGATTAAGAATAAATGGAAAGTGTAAAAGTCNACAAGACGCAGAGTTTAGTTTAAATGGTAGACCCTAAAAAAGGAAAAGAATTATGCCTTAAAAGTACCACCGAATCAACTTCAAACCACCACAAGACAAAGGTGTCCATGCAAATACAAATCAATAAAAATATTTACTTACTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G1seq18G1A05 232.63 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G1seq18G1A06
222
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G1seq18G01B06
5.36
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G1seq18G1A09
203.17
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G1Seq18G01_c1A06
93.731
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G1Seq18G01_c2A09
64.774
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G1Seq18G01_c3B06
48.867
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013