Marker information




Marker Name seq18G09
Additional Name CC000055;pPGSseq18G9;seq18G9_A1;seq18G9_A2;Seq18G09_c1;Seq18G09_c2;Seq18G09_c3
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)20
Forward primer (5'-3')
ATATCAGCGCCAATGACTCC
Reverse primer (5'-3')TCGCTCCTGGCACCTATATC
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Wang et al., 2012
Sequence ATTCAAAACCCCTACTCCCATATACGGCCGCCATATAAATTGCACATTAGTTACCAAGAGGCCGATTAGAAAAATTATTCTTCTGAATTAAAACATTGGACATTAATGGTTAAAACTTACATCGTTAACTCCCATGTCATCGAGTTCTCGTCTAAAATGTGCAGTAGGCCTCTGTATATGTTTTGTATATCAGCGCCAATGACTCCACCTAAACAAAAACATAATGATTGCAATAAGAATAACAATAAGAATAATAAGAATAACAAATTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTACAATAAAAAAAATACCGTCGCGTAAGTGAAATACCAACATCGCCGAACTGATCGCGGGATATAGGTGCCAGGAGCGACATACGCTCCCACGCCCAAACAAATTCCTGATAACATGCAAAAAATAATAACAGTATTATTTATAACAGCGATATTAAACAATATTTATTTATTATTATTCAAAAAATATTAACATCA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G09seq18G09B01 66.14 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G09seq18G9_A2A03
110.07
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18G09seq18G9_A1A06
77.92
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G09Seq18G09_c1A03
63.088
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G09Seq18G09_c2A06
47.996
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq18G09Seq18G09_c3B01
44.409
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013