Marker information




Marker Name seq19A05
Additional Name CC000070;pPGSseq19A5;Seq19A05
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)12
Forward primer (5'-3')
ATTCGTCTCCTTCTTTTGGC
Reverse primer (5'-3')TTTTGCTTCCAAATGGCTTC
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence GGGTCCAAGGCCCAACATATAAATACACATTTAATGAGCTTTTAGCTCATTTCAGCACACACAAAGAAAAGAGCGGGGGGCGCTGTTTTAAGAGAAGGAAGAAGAGAGGAGAAGTTACTATTCGTCTCCTTCTTTTGGCCATATCTTGAGTTACGGAGCTCTGATAGACAAACTATAAGTAATTTATAATTTATTATATTTGATAATCGTATTTAAAGAAAATTATTTGTTTAAAAAGTAATTAAATTAAATTTGATGATATTTTAAATTTAAAATCAATTAGAATTTTTAAATAATTTTTATTATAATAAAATATTTAAAAAAATAAAAGAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAAAGTTCCAAAAAAAAAAAAAAGAATTGGCCGAAGCCATTTGGAAGCAAAAAGAAGAAAGGAGGCATGAGACATTAAAAGAACAAAGGGAAGGAAATTTGAAACGTGGACTTAATGCATGTATACATATATATTATTATGACACCTAAGTCTTAACACACAATTCCTCAAATAATCACCATCATGCCTTTTAT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19A05seq19A05B06 51.41 Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaseq19A05pPGSseq19A5B06
63.582
Huang et al., 2016a
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19A05Seq19A05B06
82.099
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19A05Seq19A05TB06
17.431
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013