Marker information




Marker Name seq19B12
Additional Name CC000087;pPGSseq19B12;Seq19B12
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)19
Forward primer (5'-3')
CGTCCTTGTCAAGCTGTATTG
Reverse primer (5'-3')CCAATGTGCAACAAAACAAGA
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Qin et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CGTCCTTGTCAAGCTGTATTGTATTTTATAATTAATTATTTATAAAATTAAATTATCAAAACTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAAACGATAATAGCATAAATAACAAAGTGCTGAAATTATGCACTTTGCATTATCTTGTTTTGTTGCACATTGGAACAGCTCTAGACATTGTTTACATGGTAAAGTGATGTTCCACAGAAAAAACACAAAGAAACTTCGTACAACATAATAATGAAACATGACATTATTCACTTTATTTATCAGCGGGTGGATGACAAATCAAGCATGTCTCTTTCTCTTGGAGGCTAGTTAGCTAGCTAGATGCATCATGTATGTATCATGTCTGTCAAGATTAGGTTGAAACAAAACATTTTTAAAATTGATTTAATTTTATTTGAAATAAATTAAATTAAAAATCAATTATTATGTTTAAAATAAATTATCTAAAATAGAAATTAATTTAATTTATGAATTGATATAACAATTTAATTTTATATTTTGATTCTTTATTTATCAC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeaseq19B12pPGSseq19B12LG_AhXVIII 19.5 Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaseq19B12pPGSseq19B12LG_AhXVIII
19.50
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19B12seq19B12B07
64.16
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19B12Seq19B12B07
94.274
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013