Marker information




Marker Name seq19D6
Additional Name CC000101;pPGSseq19D6;pPGSSeq19D6;Seq19D06
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (TAA)19
Forward primer (5'-3')
TTTGTTATGCTCACACCCCA
Reverse primer (5'-3')AAAAATGAAGCAATATTTTGTTGTTAG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Wang et al., 2012
Peanut Base
Sequence ACCTTAAGACACACTGACATCCAAACTACCGCCAATGTCAGAACCACCAATATTTGTTATGCTCACACCCCAGTGTCATAACAATAATTTATTATTATTATCCTCAACAGTATTCTAAAAAATTAACAACATACTAACCATCATAATAATTTTTTTCCAAGACTTAATCTTAATAATAATAACAATAACAATGTCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTTACTAACAACAAAATATTGCTTCATTTTTTTAAAATAAAACTCTGTTAATAAAATGTTAATAATAACAGTTACTAATACATTTAAAATTATTAATAAGAACAACATAACAATAATTTGTTAAACAGTATTATTATCATCATAAAAAATAATAATAAATCACTAAAAAATAATAATAAATCATTAAACAGTATTATCAATTATTAAAAAATAATAATAAATTATTATCATTATCATAAACAGATTTATAAGAAACATATTAATCATAATAATAATTACTCCNATATAACAAAAATACAAATAATAA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D6seq19D6B05 35.6 Gautami et al., 2012b
Satonoka x KintokiA. hypogaeaseq19D6pPGSSeq19D6LG05.2
40.639
Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19D6Seq19D06B05
44.653
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D6Seq19D06TB05
17.704
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Tifrunner x GT-C20A. hypogaeaseq19D6pPGSseq19D6LG8
56.80
Peanut Base
Wang et al., 2012