Marker information




Marker Name seq19D9
Additional Name CC000103;pPGSseq19D9;seq19D09;Seq19D09_c1;Seq19D09_c2;Seq19D09_c3;Seq19D09_t1;Seq19D09_t2
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)18
Forward primer (5'-3')
TGTTGCCCACTGTTCTAATCA
Reverse primer (5'-3')TCAAATGGCATAGTCTCCCC
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Wang et al., 2012
Sequence CCGATTTTGAATTGTGTGATTTAGATTGTTGCCCACTGTTCTAATCACTCATTATTTCGCAGTCACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGTGATTTTTTGAGTATTTCTGTATCCGTCAAATAGTGTGTACATACATATATGACAGAAAATATAAAATTAAATATATGTAAGTAATTTTTATAGTTTTTTTTTTTTTTTTACCAAAGATAAGAGACTCGAACCCGCAACCTCTTAATTGAGTATGGGGAGACTATGCCATTTGAGCTATTACTCATTGGCAAAAATTTGGAAAGATATGTAACTCAGAACCCGCAACCTCTTAATTGAGTATGAGGAGTCTACGCCATTTGAGCTATTATTCATTGGCAAAATTTGGAAAGATAGGAGACTCGAACCCGCAACCTCTTAATTGAGTATGAGGAGTCTATGCCATTTGAGCTATTACTCATTAGTTAAAATTTGGAAAGATAGGAGATTCGAACCCGCAACCTCTTAATTGAGTATGGAAAGGTCTAT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D9seq19D9A03 92.44 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D9seq19D09B03
72.19
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19D9Seq19D09_c1A03
120.485
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19D9Seq19D09_c2A09
78.149
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq19D9Seq19D09_c3B03
113.346
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D9Seq19D09_t1TA09
38.131
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq19D9Seq19D09_t2TB03
54.212
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013