Marker information




Marker Name seq9A7
Additional Name CC000146;pPGSseq9A7;seq9A7_2;Seq9A07
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)24
Forward primer (5'-3')
TCAGCCATTCTGATTATGTAAGTTTT
Reverse primer (5'-3')TCTCAGTTTCCACGTTGAGC
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TTAGCTTCTTCTCCATCCCACCAGAATACATTCTCCCATCTTCTCCTTTGTCTGGTTCTTCTTCTTCTTCCCAAAGTAGCTGAAAAAAAAAATTATAATGTCAAGAAAACAAAAATCTAAAGATGTTAATCATCCTGAACTTCATATTATAAGATATCTCAGCCATTCTGATTATGTAAGTTTTTTTATTATTTTTTTATTTTTGAAAAATATAATTAATATTGTCAAAAATTTAGTTTTAATTGTTGTTGTTAATAGTTCAAGTTAAAAACATATTAGTGATATTATTATTTTTACTGTTAATAATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATGAGAGTTATAATAGTTGTTGTTGCTGTTAGTACTAGCTCAACGTGGAAACTGAGAATGTTATAAATGTTATTATCATGATGATTATTAATATTATTGGTATTATTAATTCAGAATTACACAACTAGAAAATGGATAAATATAGACAGATTTAGTCTTTATTACAGACGGATTTTTGGTTACCGACAAAATTACCGAC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq9A7seq9A7_2A05 85.95 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq9A7seq9A7A05
138.75
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq9A7Seq9A07A05
65.786
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013