Marker information




Marker Name seq18C5
Additional Name BZ999926;pPGSseq17C5;seq18C05
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)23
Forward primer (5'-3')
TTTTGCAAATGAATACACAAAATTA
Reverse primer (5'-3')GCCATGGCCTCATCTAATC
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Sujay et al., 2012
Sequence CTATATCTCTGGAAATAATTCCAGACAAACAGCGGTTATACGAAAGGAAACACCTATAATCTAGGAAAAAGATACTTAAAAAAAAATATCAAGAACAAAAAGAGAAAAGGGAAAAACTAAACAGAATATTAAAAATTAAATATTTTTATACTTGTCTTATTTTAAATATTAAATTAATTAATTTTACTATCTATATGTTAAAAATTAATTACTAAATTAATTATTTACATAAAATATATTAAAATAAATAATATATATTAAAAATATATAAAATAATATATATGAATATAGATAAATATATAGCGAGTGATTTTTAGTATTTATGTATTATTTTTGCAAATGAATACACAAAATTAATTATCAAAAATATTATTTGTATACTAAAACTTAGTTATTAAAATCAGTCACTAATGTAGTTGTGTATAAATATATGTGTGATTAATTTATTTTTAATATGTATTTATATTTTAATATATATTTTATACTGATGACTGATTTTAGTATACACGTAGCATAGTTGATTAATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGATTAGATGAGGNCATGGGCCCATGGANG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18C5seq18C5A04 115.79 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18C5seq18C05B04
177.66
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq18C5seq18C5A07
38.7
Gautami et al., 2012b