Marker information




Marker Name seq2B10
Additional Name CC000251;pPGPseq2B10;pPGPSeq2B10;Seq2B10
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (TAA)16
Forward primer (5'-3')
AATGCATGAGCTTCCATCAA
Reverse primer (5'-3')AACCCCATCTTAAAATCTTACCAA
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence GNAAAAATAATTTACACTCACGAATAGAATTACGGTGTAGCTTGAATCATATATATCCTACTTTAATTATTGATACCCTTAGTGAAACAAAACGTTTGACAACATGAATTAATTGGAAGTTCGTTCATTAATCAATCATCTATTTATGTATATGTTTATTTAATTTATTTGGGTAGTTCAACTCTTGAATTTTTCTATTTATTAGTACATTATTTCTAAGTTATTCTGTGATAGTAAATAGTAAATACTTATTAAAATTCGAGACTTGAGAGTTGAAAATATATATAAATTTATATTAAGGATTTTGCAACCTTAAGAATGCACATGTTTGACAAAAAGGTACACTTTCATGTGATTACGAAATACTATGAAGCAGAATAATGCATGAGCTTCCATCAAATGTGTAAGGTAAGGCTGCACTTTCTCTGATGCACAGAACACAGACACATACAATGTTTATGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACACTATGCGACACTTCAATTATAATATTGATGAAAATATTATTCAAATAAATAAGAACAATAACTTGTNTATTGGGGGTCACTTAATTTAGTTAANGGTTCACTATTGGTAAGATTTTAAGATGGGGTTTGACTTAGTATACCTAATGATACCCTAACATATAAGCAAAGCATTTAATT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq2B10seq2B10B03 236.51 Gautami et al., 2012b
Satonoka x KintokiA. hypogaeaseq2B10pPGPSeq2B10LG03.1
79.062
Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq2B10Seq2B10B03
55.367
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaeaseq2B10pPGPseq2B10AhXV
34.539
Peanut Base
Sujay 2012
TAG24 x GPBD4A. hypogaeaseq2B10pPGPseq2B10AhXV
55.9
Peanut Base
Sujay 2012
TG26 x GPBD4A. hypogaeaseq2B10pPGPseq2B10AhXV
61.1
Peanut Base
Sujay 2012