Marker information




Marker Name seq2H12
Additional Name CC000298;pPGPseq2H12;Seq2H12
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)37
Forward primer (5'-3')
CGGTCATGTCCATTAAGTGCT
Reverse primer (5'-3')CGAGCTTCGAAACTACCTCG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence AAGTGCCACGGTCATGTCCATTAAGTGCTAGAGGTGCGAGAAACTAGGAGACATGATTCAAAAAATAAATAAATACTGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACATATTAAATAAAACACTAAAAGAAAACAGGTCCAGCTTGGGGCTGGAGAACCACCCTATATAGTCCAACAAATTATGGGCCGAGGTAGTTTCGAAGCTCGACCTGTTTCCCTTCTCATCCTCTCCTTTTTAATTTAAAAAAACAGGTCAAGCTTAGGAGCTGTGATGTGGACCATAAACCTCGGCCCAAACAAACACGACGACTACCAAGATAGCTAGGAATCAGGTAACAAATCACTCAACAACAGAAGAAAGATTCTAAAAACCAATGACGACGAGAGCTGCGGGAAAGTCTGAAATATTGGGTACTTGGCACAACAGCTTCCCTATCTATTTAAACAACATCGGATTGACAGATGGAACACACAAGCACTATATAGTATCACTACTTTCTCCTTCTTTTACTTCATCTGNGATTCATTTGGAAATACTTCTTTTGATTTGAGTGTCGGAGATTTTTTTGCAGGTGCTCCACCCGTGGTGGTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq2H12seq2H12A01 20.5 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq2H12Seq2H12A01
108.342
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013