Marker information




Marker Name pPGSseq9E8
Additional Name CC000184;seq9E08_B1;seq9E08_B2;pPGSSeq9E8;Seq9E08_c1;Seq9E08_c2
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (TAA)19
Forward primer (5'-3')
TAATAAAGGTGACGTGGCGA
Reverse primer (5'-3')TTATCATGATTACCACGACCG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence AAAATAAAAACTATGTTTAAAAAAATCTTATTTATTTTAATGATTCTAATATTACTAATATATTTTTAAATCTACTTAATATACTAAAACTGGGTTTTCCCCCGACTAATAAAGGTGACGTGGCGATCCCTCGTGAGTCCGTTTTCCCTCCAAAATGCATGAAATTTTTCATCTATTCTAAATTATTTTATAAAAAAATATCTTTATTATAATTATACCAATTTAGGAACATATCTTCATTATTATTATATCAAGTCAATATTTAATGCACTATTAAACTACTTTTCAATTATCAATTAAAAATATTTTTAATCATTTTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGGCACCGGTCGTGGTAATCATGATAATATATCTCTATCCCTTTTCTATTTCAATATGTGTATATTAGGTATAATATTTTTATTTATTGTCCGAGATTTCTCTAATTATGATTGAAGATAATGATTCTAATTATGATATGATAAAATTATATAATTTTAACAAAATTAATATATGATGCAAAATTACTGTATATAATA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensispPGSseq9E8seq9E08_B1B01 41.73 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensispPGSseq9E8seq9E08_B2B03
161.43
Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeapPGSseq9E8pPGSseq9E8B03
76.88
Huang et al., 2016a
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnapPGSseq9E8Seq9E08_c1B01
23.221
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnapPGSseq9E8Seq9E08_c2B03
64.814
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013