Marker information




Marker Name seq2B9
Additional Name CC000250;pPGPseq2B9;Seq2B09
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)19
Forward primer (5'-3')
GCAACATGCTCTGAATTTTGAC
Reverse primer (5'-3')TGTGCAACCCAATTCAATAACTT
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence GTGAGGTGGACCACAAAGGCAGCAGTGGCAGAGGGACGTGGGGGTGTGGCATCAAGCTCTGGTATCCTAGCTACCGTTGCGACGGCCGGAGACGGTAGTCCTGGATACCACGCTTTTGATCATAAGCAGAAAACAGAGAGGGTCGCTGGTTCAGGGGCACTGGGGCAGCAGTTCAGAGATTCAAATCTAGGTACAGTTTTTCTCAATACTTCAGAGGCTAATCATATTCAAGATATCCACACTCTATAAACTCATTTTAAGCAACATGCTCTGAATTTTGACTCTTTTTTTATTATTTTTAATGTATTTACTATTTAAAAAAGACTTAAACATTCAATTTTAAGCAATCTTAAATTCTATACAGATCTCTTGTGCTTTAAAATTTATATGTATCAATCAAATTAGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATGGTAGTCATTTTTAAGTACACATAATAGAATTTCCAATCTTGCTATACACTATAATGATATTGACACTGATTGAAGTTATTGAATTGGGTTGCACAAATAACAAATCCTAAAATCCATTCAATTTACCTTTCAATTTACCTCTTTTNGGGTGTCAAAATTGGTAGAAAATGGTTGCTATATATATTTTGGATCTGGTTTTCTTATAATTCCTTTCCTTTTGGTTTTTCTCTGCTTTTTTGGGTTTTATTCTGGTTGGCCCGGAATTTTCAATTTTCAATTTTTC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq2B9seq2B9B09 17.59 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq2B9Seq2B09B09
82.559
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013