Marker information




Marker Name seq11E11
Additional Name BZ999474;pPGSseq11E11;Seq11E11
Marker type SSR
Motif / Pattern (GA)12
Forward primer (5'-3')
CTGCTATATTCTGGGCGGAG
Reverse primer (5'-3')CGAGAAAACAGTTTGGGAGG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TCTGCTATATTCTGGGCGGAGACTGAAAATCCAGAGAGAGAAAACAATGGCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGACATTCGATTGAATCAGAGACTTTTCTTAGTTTAGTTAGATGGAACAGTGCGTAGAGACAGTGTACTAGGGAGTGAGTCATGGGTCACCCTCCCAAACTGTTTTCTCGTCTTTAATTTTTCTATTTTATATTTTTCCACAAAGGGTCACATAGATTAGAAAATGTTAGGAACTCCAGTATAGTTTAAGTTGATAATTAAAAATTATTAAATAAAAATTTAATCAAATAAGTAAAATTTAATTTTAATATATTTTTAATAATATAAAATATTTTACATATATATATTTAATGTTTAAAATATTTTATAATGTCAATATATTAAAATTAAATTTTTATTTAATTATATATTATTTTATAATTTAGTTGATATTTTAGTATTGATCAATAATTTCAGTTTTATTCTATTCTATATCTATATGGATATTAAACTCCCAGCAACAATCACTTTTTTGAGATGGAATTGACGAACAACTAATACCATTAAC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq11E11seq11E11A05 144.95 Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaseq11E11pPGSseq11E11B05
42.049
Huang et al., 2016a
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq11E11Seq11E11A05
51.098
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq11E11Seq11E11TA05
23.111
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013