Marker information




Marker Name IPAHM105
Additional Name ER974438;IPAHM 105;IPAHM105-420;IPAHM105-290;IPAHM105_c1;IPAHM105_c2
Marker type SSR
Motif / Pattern (CT)18
Forward primer (5'-3')
CAGAGTTTGGGAATTGATGCT
Reverse primer (5'-3')GCCAGATCTGAGCAAGAACC
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Qin et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Wang et al., 2012
Peanut Base
Sequence CTGTGCTTTGCGGTTNTNACAGAGTTTGGGAATTGATGCTTCTAGTAACNCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAGTGATATCATTGATGTGGTTTATCATACACAGGCAACACTTGATGAATCTCTGTATGAGCTTGCTGGAGAACTGGTATTGTTTTGAAACACTCGTATTGTTCCCTTTAGTTGGTCAAGTAATATTAGACAGGAAATCGTGATGTTTTTCTTAAAATTCTGTGTTGGGTGCTCAGGTGAGGTTCTTGCTCAGATCTGGCAGGGAGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeaIPAHM105IPAHM105LG_AhXVII 22.5 Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM105IPAHM105LG_AhXVII
22.50
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM105IPAHM105A04
45.64
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM105IPAHM105B04
113.5
Gautami et al., 2012b
Tifrunner x GT-C20A. hypogaeaIPAHM105IPAHM105-420LGT14
13.80
Peanut Base
Qin et al., 2012
Tifrunner x GT-C20A. hypogaeaIPAHM105IPAHM105-290LGT4
38.20
Peanut Base
Qin et al., 2012
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM105IPAHM105_c1A05
57.475
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM105IPAHM105_c2B04
77.186
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM105IPAHM105AhXVII
11.066
Peanut Base
Sujay 2012
TG26 x GPBD4A. hypogaeaIPAHM105IPAHM105AhXVII
55.8
Peanut Base
Sujay 2012
Tifrunner x GT-C20A. hypogaeaIPAHM105IPAHM105LG9
47.80
Peanut Base
Wang et al., 2012