Marker information




Marker Name seq11H1
Additional Name BZ999496;pPGSseq11H1;pPGSSeq11H1;Seq11H01_c1;Seq11H01_c2
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (GA)14
Forward primer (5'-3')
TTTGTGTTTAAGAAGGGGTGC
Reverse primer (5'-3')GCGGTCCAACATCCTTTTT
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence AATTTTAATATGACTATCGGCAACTGTGATAATTATATAAATAACGTTAAAATTAAAATTACACTTTTTTATATATTTTGATAATATTTTTTAATTAATATTTTTTAAAAATATTATTTTAATTTTAACAATTTTTTTAAAATACTATAATAATTATCATAATTATTGTAATATAGTCATACTAAAATGTTCCTTTCATATATATATCACCGATTTGTCATAAATTTGTGTTTAAGAAGGGGTGCTATTAATTATTGTAGCTATTACCTCATGTAGCTTTATTAATAAATTTATTAGTTTTTATTGAACTAATTTCACTACTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGTAAACAGACCTAAAAAGGATGTTGGACCGCCATGTGGGTGGAGTTGAATAATTAGAGCTAGGTAGCTAAAATTTAAGTTTTGTTAATTAGATTCTTTGTAGGCTATTATAAC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq11H1seq11H1A02 50.44 Gautami et al., 2012b
Satonoka x KintokiA. hypogaeaseq11H1pPGSSeq11H1LG02.1
59.785
Shirasawa et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq11H1Seq11H01_c1A02
19.737
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq11H1Seq11H01_c2B02
48.146
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013