Marker information




Marker Name IPAHM245
Additional Name ER974476
Marker type SSR
Motif / Pattern (GT)13
Forward primer (5'-3')
CCCAAGGACCTAGTGACCAA
Reverse primer (5'-3')GGACCCTTAGCACATTCCAA
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TGGTGTGAGCCCGAACGTCGGTTAGGAATTTAGCATAACAAGAATCACTTCGTTAATAGCATAGTCACAACCGACGAACAACTCGCAACCAAAGTTTGGAAAATCAAGGGATTTCACAATTCAAAACCAATTATAAACCAAGAGTATTTGGACTCCCGGGTCGTCTCCCAAGGACCTAGTGACCAATGAGTGCACAATTTCGGTTGTGAAAGCAACAATGGATTTTCAATGAAGAGATAAGTAATGAAGCAATAAAAGAACTCAAAATTGCAAGTAATGAAATAATTTAGGAATTAAAGAAATAACAATGTAATATGAATAAGTAAGCTATGAAAGTGATTGATGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAAAGCAAAATGGAATCTTGGCTTGGAATGTGCTAAGGGTCCTTTCTTTGTTGGAACCACAACTATGACAATTATAATGGATTAATCTCACTTAGTTAATCCCTACATCGGAGGGTAAGTCAATTGGGCATAATTGTTTTTAATCCACAAATCCTAACTCACTTGCTAATTATCTTAGCAACAAGTTAGCGTTAGTGGAAATAAGAACAATTAACAATCCACGAATCATCACTAAATGTTGGACATTCCAACTCTGGAAACCTAATCGCTCATTTTTCCCAAGTCAAGAGGTGAAAATTTAGCCCATTATCAAAATTGACATATCCACAAACACTTGGTGGGCACAAGTGCAAATCATGGTAAAATTAAGAAAATGCT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeaIPAHM245IPAHM245LG_AhVI 48.7 Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM245IPAHM245LG_AhVI
48.70
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM245IPAHM245A06
140.63
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM245IPAHM245A06
55.158
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013