Marker information




Marker Name seq12E10
Additional Name BZ999555;pPGSseq12E10;Seq12E10
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)14
Forward primer (5'-3')
TGCTTTTAGAGGCTTTGCCA
Reverse primer (5'-3')GAAACTGCAACAGCAACAGAA
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence AAGAGGAAGAAAGGAATTAAAATTATGTATGATGGTGATGATGCGTTTGATTAAAAGGGGCAGGTGTTTTATATATATAAAAGAAACGTGGCATATATATACATGCATAAGTTTCATTTTCTTTTCTTCTATGCTTTTAGAGGCTTTGCCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATTTAATTTTTGTTTATTGAAATAATTTTTAAACTAATAGAATAAATTATAATTAAATTAAATTTCAATAATTATAAAATTTTATTTAATTATTTTTGGTAAAAAGTAATTTTAAAAAAATAAAATCTCAATAAATATAATAACTCATAAATAATTAATTATTTAATTTTAAAAAATTTGAAGTGTTATACATCCTATCAGATCTTCTGTTGCTGTTGCAGTTTCTAGAGAAAACGCTGCTGAAGTGCCTCTGTTTTGGTCTAGGTTATTTTCTTTAACTTGCCACATTTCTACTTTTACTTTGTTACTATTCCATTGATGCTACCTTGTTTCCGTTCTGTTCTGTTTCAGCCGTCATTGCTGTGATTA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12E10seq12E10A04 97.3 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12E10seq12E10B04
44.8
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq12E10Seq12E10A04
55.539
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12E10Seq12E10TA04
51.656
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013