Marker information




Marker Name seq12F7
Additional Name BZ999562;pPGSseq12F7;Seq12F7;Seq12F07_c1;Seq12F07_c2;Seq12F07
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)13
Forward primer (5'-3')
TGTCGTTGTAAGACCTCGGA
Reverse primer (5'-3')TTGGTTTCCTTAAGGCTTCG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Huang et al., 2016b
Qin et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TTTATGGAGTCTGTGTTGGACTAATGACACGTATGTGGTGCGCAGGCTTGTGTCGTTGTAAGACCTCGGATTTTTAAAAATTAAGTAATTAGTTATTTATAAATTATTATATTATATTGAGAATTTATTTTTAAAAAAATTATTTTTAACAAAAATAATTAAATAAAATTTTATGATTATTGAAGTTTAATTTAATTATAACTTATTCTATTAGTTTGAACTATTTATTAAAAACTATTTTGATAGGCAAAATTAAGTTAATCTTTTATAGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGCTTCCTTTGGCCGAAGCCTTAAGGAAACCAAAGGAAAGATAAGGAAAGCCAAATTTAGCTATTATATATATAAACATGACACGTGTATCTTAATAATCATATAATTTCATTACCCTTTTCTTTCTTCCACCGATGCCATAAGAAAAGAAATAAGAAGTATATATATATATATATATATATATA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12F7seq12F7A01 100.26 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12F7seq12F7A10
76.37
Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaseq12F7pPGSseq12F7A10
35.822
Huang et al., 2016a
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaseq12F7pPGSseq12F7A10
30.536
Huang et al., 2016b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq12F7Seq12F07_c1A01
75.96
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq12F7Seq12F07_c2A10
92.516
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq12F7Seq12F07TA10
9.266
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013