Marker information




Marker Name seq13E6A
Additional Name pPGSseq13E6A;Seq13E06;BZ999634
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAA)10
Forward primer (5'-3')
TGGCAATTTATTGATGCAGG
Reverse primer (5'-3')GTCACGTAATTGGATGCACG
Resource Ferguson et al., 2004
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence GATAGCTCAACCTTGAAAGGATTAGATAGAACTATTTGCATTGAGCTACTCAAAAATAAATGATGTTGAATGGATTTTACAAACGACTCCTTCCGTCACCCCCTGCAATTGATTTTGTTTCCAACAATGGGAAGGTATGCTTGTTTCAAACCATTCTTCATCACCTGTTAATGGCAATTTATTGATGCAGGCTAAATTTTTCTAACTTACACTTGAATTATTCACGTATAGATACAATGTTTTTTAAGCCTGCAGTTTGTGGTTGATGTTGGATTCATCTTTCTTTAACTGTGTCAAATTCGCCACTAAATATTCTAATCATAAACAAAAAAATAGTTGATTTATTTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTTAATTTTGTAGTTTTCACGTGCATCCAATTACGTGACGTCATGTCAGCAAAAATAACTACCTTTTAAATTTTTCGCATGAATGGTTATTCAAATTGTGTAAAATGTTCTACACTATCAATGCATTAAAATTAAACTCTATTATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTGAACCATGTTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq13E6Aseq13E6AA03 91.68 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisseq13E6Aseq13E6AA03
244
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaseq13E6ASeq13E06A03
59.937
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013