Marker information




Marker Name RN0x615
Additional Name AS1RN0x615;DQ099115;RN0x615_c1;RN0x615_c2;RN0x615_c3
Marker type SSR
Motif / Pattern (TAT)11
Forward primer (5'-3')
GGGCATTTAAGGGACAATGG
Reverse primer (5'-3')CCCGACCCACACATTTAACATA
Resource Moretzsohn et al., 2005
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Mondal et al., 2014
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CCCTGCCAATCCTCATNACGGCGGGGCATTTAAGGGACAATGGAAATTTAATGGTTGAAATGGCTTTGACTATTAATTCCTGGTTACCCTTAGAAACAGAAGGGTGTGTAACCTTGAAAGAAGAGGTTTTGATGGTTCAAATAGTTTGACTCACAAGGTAATTTCATGGGGGTAATCTCAAACTGTAATGTGGCATTTGTAGTTTGAGTTCAAGTTGGTTCCCTATGATGAAAATATCTGTACATAACTACATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATGTAATATATAGTTTTGAGGGAATATAAAGTTATGGTGTAACTTGCATGAGTCTTGGAACTTGCAAATTAACTTGCCTAACAAGGAAAAAACGAAGGTAAGTAAAAGGGATACATATAATTCCCCTTCTGATGTATTGTTTCTATTTGTTAATTTGGAATCCCCTAATCTTACATATGTTAAATGTGTGGGTCGGGCCNTGATTGTTGAATTGAGATCANTNNATTGTTGAATTGATNCAATGGCNACCCCTTATATTAATCTCTCCTGGTAANGANAATCCAAGTTTTTCATTNTNCCCACCCNCANCCNACCACNCNCCNNCCNANAAAACACNTTGTCGGNCNCGCCCCGNCCCCAGNNCGACNCTNAAAACCCCAACCCAACGCTTTTTTCCNATGGNGGGCCGCAANCCCAACCCNCCACCTTGGGNCCCANTTCCCNCCCCTATNAGCTGGNCNNCNAATTTNNAAATCCCCNNGGCCGGCCCGTTTTCCNACCGTCCCGGNNNCGGGAAAAAACCCCGNNGGTTNCCCCNCTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN0x615RN0x615B02 158.73 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaRN0x615RN0x615_c1A02
38.856
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaRN0x615RN0x615_c2B02
64.738
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaRN0x615RN0x615_c3B10
70.57
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013