Marker information




Marker Name gi342
Additional Name gi-30419342;gi_0342;gi-342
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (TAA)5(AAG)4
Forward primer (5'-3')
AGTGATGATGATGAAGATGT
Reverse primer (5'-3')CCTTCTGTCTGAAACCAT
Resource Moretzsohn et al., 2005
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence AGTGATGATGATGAAGATGTTATTACCACTATTACTAGTAATAATAATAATAACAATAATACTAGGGAAGGGTACTTAACTGTTGTTGCTGAAAAGGGTAGAGAGAAAAAGAGGTTCAGTATTGAGTTGGATTACCTGAATGATCCTGAATTCAAGTTGCTGCTTGATCAAGCTCAGCAAGAATATGGTTTCAGACAGAAGGGAGCTCTTTCTGGTCCCTTGCAGGCCTCATGAACTCCAAAAGATTTTGGATGGTGGCAATGAAAGAAGGTTGAGTAGGTCATAATATTCACTATCTAGTTTCATGTGTCTTCTGTTTTTCTTTTCCAGAGTTAATTAAGCTTTTCTTAATTATTATATGTTAAAAAAGAAGAAGAAGAAAATGGTTATTATTAAGTAGCTAGGGCACCAAAGGTGCTGATGAAATAATATACCATCCCTAATGGATGTATGTGTTATAAAAAGCTACTAGCTATAGTGATATATAGTTTATAGATTAAGGATATGTATATTTTATATTATATATACTAAGGCTAATTAAGAAAGCCTTTTTGGTGCAGCATGAAATAA


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisgi342gi_0342B02 12 Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnagi342gi342B02
96.654
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisgi342gi342TB02
78.135
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013