Marker information




Marker Name IPAHM97
Additional Name ER974434
Marker type SSR
Motif / Pattern (AC)11(TC)18
Forward primer (5'-3')
TCAGCTGTCTCTCTGCTCCA
Reverse primer (5'-3')CTCCAAGCAAAAAGTTGAAGG
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Sujay et al., 2012
Sequence TATTTTGCTAATTGTNNTCGACATATANNAAGTCCATATATTTACCTTTCCNATTTCTCTTACACTTCTCCCTTATCTTAATTACTATTATTTCTTTCATTTTCATTTTCCTATTCTTAGCCTCCTTAATTAAGTAGTCATTTAAAATAATATATATTTTAGTAAAAACTCATTTACAGTTTTATTTGTATAAAATTAATAATTAAAAACTCATTTACAGATTGATAATAATGTAGCTGAAATTTAGGTTTCTTAATTAATTTTTTTTAATACTACTCCACAGGATCGACGACTTAGAATTCAGCTGTCTCTCTGCTCCAAGTGACAGTCAGTGAGGTTAGCAAGCACACCCTGATTCTCAAAAAATTCTGTGTGATTTGTTTATCTATAGTGGTTGGATTAGGTCTTTTCTTGGGTCTTCTGATTGTGATTTTGCCATAGTAAATTACCAAATTTCCCTTGCTCATGATTTTATAAAAATAATACTCTAACACACACACACACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCCCTTCAACTTTTTGCTTGGAGTTAAGGTTAGTGCAATTCTTGTGTTATAAAACTTCATTGATTTCTAGGGTATTGTATGTTAAATGAAATATNACTTGTGTTGNGTTGNTGCTTGTATTGCATTGAAAACATTGATANGGNTAAATATTGATAGCATGNTGTATGATAGATGAAATGNTGCTTGTGNTGGNTGATTTATANGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
ICGS 44 x ICGS 76A. hypogaeaIPAHM97IPAHM97LG01 8.1 Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM97IPAHM97LG_AhXVII
32.70
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM97IPAHM97B04
66.68
Gautami et al., 2012b