Marker information




Marker Name IPAHM406
Additional Name ER974524;IPAHM406_A;IPAHM406_B;IPAHM406_c1;IPAHM406_c2
Marker type SSR
Motif / Pattern (GA)9(GA)8(GT)5
Forward primer (5'-3')
TGAAAGGGATTGGACCAAAA
Reverse primer (5'-3')TGTTGGACAGGATTTCACACA
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CTTAACTCCTTTCAAAAAGTTGAAAGGGATTGGACCAAAAATCNCTGAGCGAACACACAAATTAGTCTTCTAATAATCAACTACTGTGCAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATGTGTGTGTGTTAGAGTATTATTTTTATAAAATCAACACACAAATTTATGAATATTTATAAAATAATATTTCAAGATTAACGTAATATATATTTGACTAAAATATCTTTTACTAACTATATATAGAAAAGAAAATTAAATATTATAGGTAACTTTATCATTCTTGTGTGAAATCCTGTCCAACAAGTCAAGAATTTAGAAGAAGCAAGAAGAGAATGTGTATAGATCGCAGAACGGTGAATCTCAAAGAAATAGAATAATAAATGAAGTTATTAATTAAAAATTATTAAATATTTTATCATATTTAATTAAATTATTATTTAACGGCCTTAACTAATAACTTCTTTAATAATATAGGAAACGCTTGAGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM406IPAHM406_AA02 43.90 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM406IPAHM406_BB08
0.00
Peanut Base
Fonceka et al., 2009
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeaIPAHM406IPAHM406LG_AhVIII
73.5
Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM406IPAHM406LG_AhVIII
73.50
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM406IPAHM406A02
17.9
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM406IPAHM406B08
54.16
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM406IPAHM406_c1A02
40.662
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM406IPAHM406_c2B08
50.345
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013