Marker information




Marker Name IPAHM540
Additional Name ER974557;IPAHM540_A;IPAHM540_B;IPAHM540_c1;IPAHM540_c2
Marker type SSR
Motif / Pattern (TA)4(TG)12
Forward primer (5'-3')
TGGAGAACTAGGATCTCTTTTGTG
Reverse primer (5'-3')CCTAACTCAGCCTGCGAAAC
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CTCTTAGAGGTGTTTGGAGAACTAGGATCTCTTTTGTGTATTTTGGGCTATAGGTTTTGTATATATATGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAATATTCTACGACCAACCTTAGTTTCGCAGGCTGAGTTAGGAGCTTGATATTCTGTACCGTTCAATTTAAGTGATTTTTATTATGAATGAATTATATATGTTCTATTTTATTAATTTATACTCTTAGAGATTAATTTACTAGAAATAATTAGTTTGATTTTTATAAATAGTTTAAGTTTAAGTTAATTAATGTTTAAGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM540IPAHM540_AA08 97.30 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM540IPAHM540_BB08
15.00
Peanut Base
Fonceka et al., 2009
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM540IPAHM540A08
93.71
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM540IPAHM540B08
104.26
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM540IPAHM540_c1A08
51.106
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM540IPAHM540_c2B08
53.336
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013