Marker information




Marker Name RN9A05
Additional Name AS1RN9A05;DQ099064;RN9A05_A
Marker type SSR
Motif / Pattern (TC)8
Forward primer (5'-3')
GTGCGTCTCAAAGCCATCG
Reverse primer (5'-3')CCCATACATTCAAAACTCAAAAGAGC
Resource Moretzsohn et al., 2005
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence TCACAACTTCCCACTCTCCCCTTAATTAGCTTCTATTACTCTTCCATTATTATTATAATAATAATGGCTCGCTCTCTTCCTTTGCTTTCCACCATTTTTGTCCTTCTTTTGCTTCTAGTGGCCACTGAGATGGGACCAATAACGGTGGTTGAAGCTAGAACTTGTGCGTCTCAAAGCCATCGCTTCAAAGGAGTGTGTTTGAGCGACACAAATTGCGCCTCCGTTTGCAAAACGGAGGGCTTCCCTTCCGGGGACTGCCACGGCTTTCGCCGCCGATGCTTCTGCACCAAGCATTGTGCTTAAACAGACATCTTATTAGTCAATAATTTTCATGGATGAAGATGATGGATCTATCATCTTTTAATCCTCATCATGCATGTGTTATAAACTTTTGTGTTTTAAGAATAATAATGTTGTGCACTTTGGGTTTGTTTATTTAATTTGTCTATCTCTCTCTCTCTCTCATGTTTTTCTAGCTCTTTTGAGTTTTGAATGTATGGGTAATATTCATGGTTCTT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN9A05RN9A05_AA01 56.40 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN9A05RN9A05A01
130.64
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaRN9A05RN9A05A01
70.477
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013