Marker information




Marker Name RN17F12
Additional Name AS1RN17F12;DQ099096;RN17F12_A
Marker type SSR
Motif / Pattern (TTA)23
Forward primer (5'-3')
TCATCACACTCCAAAAGCAC
Reverse primer (5'-3')GCAGGATTCAACACCAGTAGTAG
Resource Moretzsohn et al., 2005
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Wang et al., 2012
Peanut Base
Sequence AAGAACTACTACTATTCTCACCGTACCTTGGGTGTGCTAGTGATTCTTCTTGCGTTTTCTTATCTTCTTATATGCTTGAAAGCAGTTCCAATTACAAGAAGTGAAAGCCTCATGCAAGGTTCTCAAGCCCATGCTAGTAACCACAAGGATGAGGATATGAATAATGATGAAAAAACAGAGAGAATGGATTTGGAACTGCTAGACTACCAACCACCGGGGGCTAATGGTCATCACACTCCAAAAGCACCGTGATGACACTATATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATGTAACTCGTTATATATTTAGAGTAGTATTTTAACTTAGTCTTTTAGCTAAGAAATTAGTATTATCTAGTTTAATTGTGCATCATAAGAAGAACTACTACTGGTGTTGAATCCTGCATCACTATCTAGTTTAATTTGATATGGATATGGGAAATCATCATGATAAGTCTTTAATTGTATTTTTTAAATTAAATTCTGCTTTCTAATTCAAAACC


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN17F12RN17F12_AA01 145.20 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN17F12RN17F12A01
52.82
Gautami et al., 2012b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaRN17F12RN17F12A01
116.928
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
A. hypogaea Runner IAC 886 x (A. ipaensis K30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisRN17F12RN17F12TA01
100.185
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Tifrunner x GT-C20A. hypogaeaRN17F12AS1RN17F12LG6
6.50
Peanut Base
Wang et al., 2012