Marker information




Marker Name gi4925
Additional Name gi-29824925;gi-4925_A;gi-4925;AY232826
Marker type Genome-SSR
Motif / Pattern (ATT)13
Forward primer (5'-3')
AAACTTGTATGTGTAGCAGACC
Reverse primer (5'-3')GGTGAAAAATCGGAAAGA
Resource Moretzsohn et al., 2005
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Shirasawa et al., 2012b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence ACAACAAGAATAACAGGAGAACTTAGAACAACAACGTAGAAGAACAGTGTAACAAAGAAGCAAGAATAACAGTAAATCCTAGAACAACGACGTAGAAGAAAAGTAAAACCTAGTTCGTAATCTGAAAAATATACAGGAATCTTAATGAACTTACCTTGAGTATTGTTGCTTTGTTTTCTCTTCAGATTCTTGATGGAGAGTTTGATGGTGTGTTGATGGAGGTTTCGAAGGTTAGCGACGACTTGTATATTTTGAACTTCGATTTTCGCTCGAAAATGGAAAGATTGCTTTGTTTTCGAATCGCTTTGAGAAGTGGAAGAAGTGGAAGAGTCTGCCATCACTCGTAGCGTGCGTAACCGTTTGAGTAGCGAGCGCGTGAATGTGACGCTCCATTCAATCCGTCTTCATGCGCGTAAGTTGTATTTGGGCTGGGTCAACTTGTAAACTTGTAAACTTGTATGTGTAGCAGACCCGAAAAAAGTTAATAAACACACAATCTTTTTGTTTGTGATTATAATTAGAAACTTACTACTCTCTCTCTACTATATTTTAATTAATAATATTATCATACAAAAAAGACTTTTTTTTAAATAGAATCTAAATAAAGTAATCACTACAAGAGATTTGATTATTTAACTATAAAAAGTTTGATTATTTTACAGTAAAATATTTGATTATTCTAATAATTGATTTTTTATTAAAAAATATAAAATAATATGTATAAATATATATAAATATTCAATTACTAATTTTTTATGAGTGATTTTTGGTGTTTGTAGAATATTTATCTTCAGAATTTTTTTCATCGAACTGTCAAAATATAGATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATGAAAAAGAGAAATATAATTATATAAATATATAATTATTAAAATAAGTTGAATCTTTCCGATTTTTCACCTTAATCTCAAATTGAGTTGTTTTTTCCAATTATATAAAAATGATGAAATTGTAAAATTAGTATTTTAAAAATAAAAGAAGAAATGCAGGCAGAGAGATTCCTACAGATAAAAAATTCTCAAGTGATGGGAGACGTATACGAATACGACCCACATGGGTTGTGAGGTAGTCCAATGAATAACGCATACTACTACTAGATAGGTCTTTATACGGCTATAAATAGTGGATCATGTTTGAAGCCTTGGGAGGCATAGCAGCATACATAGCATTAATTTATTTGCATTCCACAGATAATTAAGTCATCAAAATGTCGAACACCTGCGGAAACTGCGACTGCGCTGACAAAACCCAGTGCGTGTAAGTCCTTCACTTCTATTTGCATCTATCTACTTCTCCATTACAAATATGCTTTTTCATATCTCCTTCAAAATATAATTCCTTTATGCAACATTCTCCAAAATTATTGCTAAAAGACTTAGCTTATTAGGCTAGAAATTATTATTACACTTGTTAAAAGCCAGATTTTTCCAACCACGCTTGTCTAGGACAAATATGTTTTGTACACATTCAATTTGAATAAAAATATGTTGACTAAATTATTGTTTTTGTCTCTAACATTTGGGGTAAGTCTTATTTGTGTTTCTAACGTTTAAATCGTCTTATTTGTATCCTTAACGTTTATAAAAGTGATTCAATGTTATCCTACTATCAATTATACTAACAGATCAGATTATATTTTTCAATTATTCTCACTTAGATGTATTCATTCTCAATTAGGTTTTACTTGGATGTGTTCAATTTTAATATTATACCCACTATTTATATTTAGATTCAATTATCTCCCTAAAAAAGTGAATTACGTAAATGTTATAGAAATTAGTTTCAACTTTTGATGAGCTATTTTTCAAAGTGAATCATCAATTCTATTCTATAAATTTGTATTCTAACTTCAAGAATAAATTTTTAAAACTCAAACTAAAGCATTCATGATGTGTAATTAATGGCAGGATAATATTGAATCACTTTTACAAACATTAAGGATACAAATAGGACGATTTAAATGTTAGAGATACAAATAGAATTTACCCTAAATATTGGAGACAAAAACGATATTTTATTCAAATATATTCTTTTGTATTCACCGTCCTCCATGAAGAAAAAAAAAAACTGTTTATCAATTTGTACAAGTATTTGCTTTTCTTCCAAATAAGAAGAAAGCATGAAGAAACTGAGAAAGAGGAGAAAAAAGTTAAATGAAGAGCATAAGAAAAACATAATTAAAAAAATTAACAACTAATTTAGTATCGAAAAGATTTAAATCTTTGATTGATTTAAAAATGTGATAAGATTTTTTTATTTTTTAAAAAAATTTGATCATTCACGTAATAAATTTTTAAAAAGATTCATTTAACATAAAATTGTCAAATTTTAAAGATGAAAATTTTATTTTTTTAATAATACTTACAAAAAATTACATCAAAATCTAAACTATAAAATTAGTTTTTAAAATATATATTTAATATCTGATTTTTTTGTCAATTTTTTAATTTTTCGAAAACTTATTTATTGTTAGAGTTTTTTGGAATTATTTTTGTGACCGATGTGAACTTTTAAGTATTATTTTAGTAATTTATTCTTAAAAAAATAAAATGAAGAATGGCAAACAAAAGTAAGAATGAAGGGTAAAAAAAATAAAAATTAACGCACGCATGCTTCTTGAAATGTCTTGTGAACTCCAGTAGCAAAATCCAATTCTTACCAGACTACACTATTTGCATACGGAGTAGTATTGGAAGGTAATATCTAATACGATCAAAACTCTAATAAAATATAATAATATTTGGTGTTAACTATAGAAAATTCTAGTACGCTACTAACACATTTCAGTATTTCACATAAAAATATTGGTTAAATCCAAATATACGTTGTACAAATTTGGAATAATAAAATTCCTAAAGATGAGAAGAATATGTTTAAATTTAAATTATAATACATCAAATTTTATATCCTATTGACTAACTTGATTCTCGACGCAAAGAACCTTATGTGTGTTTAAATTGGAGTAGTATACTTAGCTTGCAAATAGAGTGCGCAGAAGAAAAAAAAAATTGATACTAGACAGTTTTCTATTATTAAAAATATAAATTCAAAAATAGCTTTTTGAAAAAATATAATTATCTCAAAATAAAATCATTTCATAAATATCATAATTTAATTTTGTGCTATATGCCTAATAATAATATTTTGATACTTGGATTTACAAAGATAACTCATTCTTTCATTATTTATGTTCAGGAAGGGAAACAAATACGGTGTTGACATCGTGGAAACCGAAAAAAGGTAACCTCTACATTTTGGCAATTTCTAATTTTTCTTTAATTTGTAAACAAATACTGACCTAGTGTCCTATTCTCTAATTTTTTAAATAAAATATTATTTTTATTCCTAACATTTGGAGTATATTTTAAAATTATTTCTATCATTTAAATTGTCCAATTTAAAATTGTGTCGACATTATCCTACCATTAGTGATTTGTTAATGAAATTGACGGTAAGATAAAATTGAGATAATTTTAAAATGTTAGGGACAACTTATTCTTTACTTTCTTTTATTAAGTAATGTTTTTGTTTTATTTAAGTCTTAACGTTTTAAAATCGTTTCAATTTTTTTTACCATCAATTATGTTAGCAGATTCCTAACGACAAAACAATATTAAACAAATTTTAAAATATTAAAGATTTAAATAGGACGATTTAAACGTTAACTGACCACAAACATTAAAGATAAAAACTATATATTTTTTTTACACTTTTACTTCCTACTATTTCTGAGAATACCAATTATATTTGGTTTCAATAATTTTTTTAATCTCCGATCTAATGATTGTCTTACTCGTGATGCAAATCCAGAAAGCTAAATACAATAATTACACGGGAAAGCTTATTAAAATTGCAATATATATGTTTTTTTACAGGATGGTGGAGACTGTGGTGATGGAAGTTCCAGCTGGTGAGAACGATGGGAAGTGCAAGTGCGGTGCTAACTGCTCTTGCACCAACTGCACCTGTGGCCATTAAGTATAATGTAATTGCCAAATCTGTTTGGCAATAATAATATGTACTCTTTTACTAAATAAAACTGTGTGCTGTTGTCGTATTGCATATCTGTGTGAGTAAAATGCACTCTACGTATTTGAATCAAGTTTCGTTCACAGTGATAGCTAGCTATATAACAGCCATGGCTCTGCCATTTTATGGTTACATTTATGGACTATAATATGCATATCTCTTGCTAGTTGCTTCCTACCTTAGCTTCATGTCTCAGTTATTATCATGAACATCAAATTTTATATATACACTTAAACTCCAACACCAACAACCGTAATAAAAAATGAATTTTG


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisgi4925gi-4925_AA03 61.00 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeagi4925gi-4925LG_AhIII
106.2
Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeagi4925gi-4925LG_AhIII
101.69
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisgi4925gi-4925A03
168.2
Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeagi4925gi4925A03
72.894
Huang et al., 2016a
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnagi4925gi4925A03
81.978
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013