Marker information




Marker Name IPAHM290
Additional Name ER974494;IPAHM290_A
Marker type SSR
Motif / Pattern (TA)3(CA)3CC(CA)5(TA)8
Forward primer (5'-3')
CCACCGCTGATGTGTAATTGTA
Reverse primer (5'-3')GACGTGTAGTTGAAAACAACAGTATCA
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Huang et al., 2016b
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence CNACCGGACACTGGCATCACTATCAGGATCCCCACCACCGCTGATGTGTAATTGTATAATGTTGTTGTTTATTATTATCTATAAGTAGTTTATTATAGTTATGTTGCATTTGGTTATATGTAGTAATTTTATAATGTGGTTGTTTTTATAATTTAAATAAAGCTCAGTAGAGGTTGTATTGTAAATTGTTGTTGTTTATTACATTCTTGTAGTTTATATACACACACCCACACACACATATATATATATATATATGCTTTGTTTATATGCAGTAATTTTATGATACTGTTGTTTTCAACTACACGTCTTATAGAAGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
A. hypogaea Fleur 11 x (A. ipaensis KG30076 x A. duranensis V14167)4xA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM290IPAHM290_AA07 49.00 Peanut Base
Fonceka et al., 2009
ICGS 76 x CSMG 84-1A. hypogaeaIPAHM290IPAHM290LG07
115.6
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM290IPAHM290LG_AhVII
174.79
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM290IPAHM290A07
115.88
Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaIPAHM290IPAHM290A07
48.021
Huang et al., 2016a
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaIPAHM290IPAHM290A7
11.404
Huang et al., 2016b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM290IPAHM290A07
80.694
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013