Marker information




Marker Name IPAHM524
Additional Name ER974548;IPAHM524b;IPAHM 524;IPAHM524_c1;IPAHM524_c2
Marker type SSR
Motif / Pattern (GA)20AA(GA)3
Forward primer (5'-3')
GCCATGGATAAGAACCTGAAA
Reverse primer (5'-3')CAGTAAGCTGAGCTGGCAGA
Resource Cuc et al., 2008
Fonceka et al., 2009
Gautami et al., 2012a
Gautami et al., 2012b
Huang et al., 2016a
Huang et al., 2016b
Qin et al., 2012
Shirasawa et al., 2013
Sujay et al., 2012
Sequence GGACNACGAANTTTCTTCATCCAGCTTGAATGACACTGTGTTTATTGCTTGCGCACTTGAGGTTGCGGAAGCTTGAGGCTCACTTGGAGTAGCCATGGATAAGAACCTGAAAGCTCTGATACCATGTCAGGTATCAGAACTCCTCAGAGAAGATAATGTGAAAAACCAGCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGATCTAGAAAACTCTTTTCATAGAATGTAAATCAGAGAAAATGATTTCATTAGCTGATTATTACATTGACTCTTAGTCTTATATAGTAGCTTTTATAGTAACTACTAACAACCATTAACTGTTCTCATAACTGGCTAACTAACTCTGCCAGCTCAGCTTACTGGCTCAATTGCTATTTATTCCTAATACTATGTTTGTTGAGTCGTTTTTGCCTCAGTTGCTTTTTGTAATTTTTTGTGTTTTTGTTGCTATTGAATCTGTTGCTATGTTGTCGAGTTTTTGTATTTTGAATCTATTGCTATTTAAGCCTTTGATTAAATTATCATATCAAATAAAAAAGCCTAAGACATACAATACAAACAATTGGAAAATCCAAAAATGGACTCGTGTAATTTAATGAGTTAATATTCAAAATGGCCCCTGAAATTTGACTTCAATTTAATTTAGCCTTTTAATTTTTAATTGATCCAAATTGT


Linkage map Species Marker Name Name used in map Linkage group Position (cM) Reference
TAG 24 x ICGV 86031A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524LG_AhX 41.0 Peanut Base
Ravi et al., 2011
Gautami et al., 2012a
ICGS 76 x CSMG 84-1A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524LG10
54.9
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
ICGS 44 x ICGS 76A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524LG10
7.9
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM524IPAHM524LG_AhX
46.33
Peanut Base
Gautami et al., 2012a
Consensus mapA. hypogaea, A. ipaensis, A. duranensisIPAHM524IPAHM524bB06
41.49
Gautami et al., 2012b
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524B06
79.558
Huang et al., 2016a
Zhonghua 10 x ICG12625A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524B6
57.186
Huang et al., 2016b
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM524IPAHM524_c1B02
46.112
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaea, A. duranensis, A. stenosperma, A. ipaensis, A. magnaIPAHM524IPAHM524_c2B06
73.524
Peanut Base
Shirasawa et al., 2013
Consensus mapA. hypogaeaIPAHM524IPAHM524AhX
35.675
Peanut Base
Sujay 2012
TAG24 x GPBD4A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524AhX
77.8
Peanut Base
Sujay 2012
TG26 x GPBD4A. hypogaeaIPAHM524IPAHM524AhX
68.4
Peanut Base
Sujay 2012